El área de investigación trabaja en el levantamiento, organización, análisis y generación de información, para contribuir a la toma de decisiones, a través de la creación y aplicación constante de metodologías innovadoras de investigación ecológica, geográfica y social.

De esta forma se contribuye al desarrollo de líneas de monitoreo ambiental, lo que permite detectar e identificar continuidades y tendencias en situaciones particulares, ayudando a generar estrategias y programas para el mantenimiento de las condiciones de cada lugar y especie de interés.

Algunas de las iniciativas que se han desarrollado en esta temática corresponde al establecimiento de un programa de monitoreo de aves enfocado en la realización de censos, estudios e investigaciones sobre aves acuáticas playeras y marinas. Estos datos obtenidos se constituyen como insumos para estudios e investigaciones en conjunto con la academia, con el objeto de mejorar el conocimiento sobre la ecología de las aves y sus necesidades de conservación.